Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA6Q92908 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATA6Q92908 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms