Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP6NLQ92738 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6NLQ92738 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms