Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABGGTAQ92696 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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