Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN4Q92575 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms