Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA1

POMGNT1, Protein O-linked-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT1Q8WZA1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POMGNT1Q8WZA1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POMGNT1Q8WZA1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POMGNT1Q8WZA1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POMGNT1Q8WZA1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POMGNT1Q8WZA1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POMGNT1Q8WZA1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POMGNT1Q8WZA1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POMGNT1Q8WZA1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POMGNT1Q8WZA1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMGNT1Q8WZA1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms