Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF4Q8WXU2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF4Q8WXU2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms