Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRSF12Q8WXF0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF12Q8WXF0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms