Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms