Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF3C2Q8WUA4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C2Q8WUA4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF3C2Q8WUA4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C2Q8WUA4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF3C2Q8WUA4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms