Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD1Q8NHV4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms