Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL2Q8NHH9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms