Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL8

TMEM116, Transmembrane protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM116Q8NCL8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM116Q8NCL8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM116Q8NCL8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms