Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HJURPQ8NCD3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms