Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF1Q8N6C5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms