Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms