Protein–RNA interactions for Protein: Q8N108

MIER1, Mesoderm induction early response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIER1Q8N108 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MIER1Q8N108 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIER1Q8N108 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms