Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXP4Q8IVH2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP4Q8IVH2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms