Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALYREFQ86V81 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms