Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4DQ86TL0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG4DQ86TL0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms