Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD1L3Q7Z443 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKD1L3Q7Z443 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms