Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDXQ7Z353 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDXQ7Z353 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms