Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
STRCQ7RTU9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCQ7RTU9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms