Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYFIP1Q7L576 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms