Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM136Q6ZRR5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM136Q6ZRR5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms