Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms