Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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