Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF7Q6Q0C0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms