Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC137Q6PK04 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC137Q6PK04 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms