Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A1Q6PCB7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms