Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF40BQ6NWY9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF40BQ6NWY9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms