Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RGMBQ6NW40 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms