Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWSAP1Q6NVH7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SWSAP1Q6NVH7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms