Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSAPQ6IQ19 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms