Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA2Q69YH5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms