Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms