Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1DP3Q658K8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms