Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD13Q5VXD3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD13Q5VXD3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms