Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF18Q5VWM3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms