Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCERG1LQ5VWI1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms