Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOCADQ5VW36 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOCADQ5VW36 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms