Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf135Q5VTT2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms