Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GKAP1Q5VSY0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GKAP1Q5VSY0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms