Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEXMIFQ5QGS0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEXMIFQ5QGS0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms