Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC158Q5M9N0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC158Q5M9N0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms