Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHC1Q5JVL4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHC1Q5JVL4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms