Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGD3Q5JSP0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FGD3Q5JSP0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms