Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD12Q587J7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms