Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms