Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms