Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL22Q53GT1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms